El Consejo Consultivo Regional para las Aguas Noroccidentales consta de varios niveles de representación. Esta estructura organizativa pretende facilitar el acceso y la participación del mayor número posible de miembros y observadores en el procedimiento de debate y consenso de propuestas, en un esfuerzo por aunar eficacia e integración.

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Tanto en la Asamblea General como en el Comité Ejecutivo se asignan dos tercios de los escaños a representantes del sector pesquero, y el tercio restante a representantes de los otros grupos de interés respecto a la Política Pesquera Común, conforme a lo dispuesto en el artículo 1 de la Decisión 585/2004/CE del Consejo.

Las normas de pertenencia al Consejo Consultivo Regional están recogidas en la Decisión 585/2004/CE del Consejo (ver sección de "Reglas de funcionamiento").

Asamblea General

Todos los miembros del CCR-ANOC lo son también de la Asamblea General. Tienen derecho a voto los representantes del sector pesquero y los otros grupos de interés. La Asamblea General se reúne con una periodicidad mínima anual (habitualmente a finales de Septiembre en Dublín).

La Asamblea General nombra un Comité Ejecutivo que se encarga de dirigir y coordinar las actividades del CCR-ANOC.

Comité Ejecutivo

El Comité Ejecutivo tiene el cometido de gestionar la actividad del CCR-ANOC y de adoptar sus opiniones, recomendaciones y dictámenes. La composición del Comité Ejecutivo se limita a un número máximo de 24 miembros y cuenta con una representación equilibrada de todas las partes afectadas por la política pesquera común.

El Comité Ejecutivo coordina el trabajo diario del CCR, y es el órgano de adopción de recomendaciones y opiniones.

El Comité Ejecutivo se reúne en sesión ordinaria tres veces al año como mínimo.

Grupos de Trabajo

Debido a la extensión geográfica de la zona que abarca el CCR-ANOC, se decidió en la Asamblea General inaugural que la actividad y competencias de este Consejo Consultivo Regional se asignarían a diferentes grupos de trabajo constituidos por subzonas específicas.

Estos grupos de trabajo son los siguientes:

• Oeste de Escocia - zonas Vb (CE), VIa, VIb - Accesos Occidentales    [GT 1]
  
• Oeste de Irlanda y Mar Céltico - zona CIEM VII (excepto d, e y a)    [GT 2]
  
• Canal de la Mancha - zonas CIEM VIId y VIIe    [GT 3]
  
• Mar de Irlanda - zona CIEM VIIa    [GT 4]

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Los Grupos de Trabajo se encargan de la discusión, el trabajo y la preparación de propuestas y son el último árbitro de valoración de las mismas antes de su remisión al Comité Ejecutivo.

 Los Grupos de Trabajo ayudan al Comité Ejecutivo en la preparación, debate y elaboración de propuestas y orientaciones específicas para cada zona pesquera en el marco de los objetivos globales del CCR-ANOC. Los integrantes de los grupos de trabajo podrían llegar a variar en función de las cuestiones que se sometan a debate. Los grupos de trabajo permiten la participación de una amplia serie de expertos técnicos y científicos y amplían el ámbito de participación de las partes interesadas.

Los Grupos de Trabajo creados por el CCR dependen directamente del Comité Ejecutivo y operan de acuerdo con las reglas y los procedimientos establecidos por la Asamblea General del CCR-ANOC. No obstante, los Grupos de Trabajo también pueden en ocasiones disfrutar de un cierto margen de discrecionalidad, según la diversidad de características y recursos pesqueros que estén bajo su competencia, a la hora de desarrollar su programa de trabajo.

Grupos de Enfoque

Los llamados grupos de enfoque son grupos de trabajo consultivos propuestos por los Grupos de Trabajo de subzonas y formalmente constituidos por el Comité Ejecutivo. Los grupos de enfoque se ocupan de cuestiones o asuntos concretos de interés específico cuya complejidad técnica requiere un análisis o tratamiento riguroso diferenciado por parte de un número limitado de miembros con amplia experiencia y conocimientos en la materia.

Su misión principal es la de asistir al Comité Ejecutivo en su labor de preparación de recomendaciones o dictámenes. Los grupos de enfoque se constituyen con carácter temporal o ad hoc y su número y contenido pueden variar de un año a otro dependiendo del programa de trabajo (prioridades, procedimientos de consulta abiertos...) y de la disponibilidad presupuestaria.